智利货物水上运输主要以海运为主。2012年智利港口货运量（包括转船，不包括沿海航运）总量9900万吨，比上年增长3%，其中51%为进口，49%为出口，亚洲是最重要的目的地，运输货物中26%为集装箱，11%为零担，63%为散货。智利主要港口有：瓦尔帕莱索、圣安东尼奥、阿里卡、伊基克。