牡丹的繁殖方法有好几种方式，各不相同，通常我们引入的牡丹苗大略有嫁接苗、分株苗和种生苗这三种，其中以嫁接苗为主。嫁接苗由于采用的砧木不同又分为凤丹根嫁接苗和芍药根嫁接苗两种，她们各有自己的优势也存在着各自的不足，不能笼统地说究竟谁好谁坏。
南方牡丹种植区由于具有湿度大、雨水多、地下水位高等环境因素特征，个人倾向于选用芍药根嫁接苗要更占优一些；北方牡丹种植区气候干燥、雨水少、地下水位低，芍药根嫁接苗和凤丹根嫁接苗都可以选用，两者没有明显的区别优势。
不管是用芍药根进行嫁接还是用凤丹根进行嫁接 ，嫁接幼苗经过多年倒栽后能够进行分株的分株苗是最佳的牡丹苗，但这种繁殖方法生产周期长，费时费力，而且只有自身根系强大的品种才能进行分株。
由于牡丹的繁殖方式不同，品种不同，自生根长势不同，使得花友们到手的牡丹苗状态各异。我们在栽种的时候要区别对待，针对苗木的不同状况应分别采取各自相应的措施，从而来提高成活率。