乌干达咖啡豆进口到中国的清关流程大致如下：
1.国外发运：指货物在国外装载并开始运输。
2.收发货人备案：进口商需要在海关系统中进行备案。
3.到港后报关：货物到达中国港口后，需要向海关申报。
4.海关缴税放行：根据货物的种类和数量缴纳相应的税款，海关审核无误后放行。
5.检验检疫抽检：海关会随机抽取货物样本进行检验检疫，确保货物符合中国的安全和健康标准。
6.出国内入境货物检验检疫证明：一旦货物通过了检验检疫，就会颁发入境货物检验检疫证明，此时货物可以在市场上销售。
进口乌干达咖啡豆的具体税率如下：
- 进口咖啡生豆关税：8%，增值税：13%
- 进口烘焙咖啡豆关税：15%，增值税：13%
需要注意的是，部分国家和地区与中国有贸易协定，出具优惠产地证后，货运直达可以享受0关税。