正式開始前，先讓我嘮叨幾句。這個分析其實上年就已經打算做，一直拖到今天才正式動手，我不得不承認自己是一個大懶蟲2333
當我以純分析的心態去重玩遊戲，記錄劇情時，真的是處處詭異，細思恐極！現在就讓我為大家拆解這個看似美好的糖衣包裝，給大家看清內裡的苦澀真相！
為了放便大家理順劇情，我會由父母輩的故事開始，按時序給大家好好解說故事的前因後果。歡迎大家在看完我的分析後，一起討論，或許在你們眼中又看到不同的結果也說不定(笑)
廢話不多說，現在開始分析……大家跟緊腳步啊！
其實故事主線劇情之所以發生，晴人會被關進收容，絕大部成因是與父母輩（又稱一場因暗戀失敗引發的血案）有莫大關係的。
政木和博從30年前開始，就暗戀著當時單身的涼子，可惜他這悶騷就是不敢主動表白，一定等涼子注意到他的心意【吐槽：以晴人媽的性格，你不說她會明白才怪！我能說你活該麼……】甚至因涼子很喜歡銀蓮花，為了她在溫室種滿紫色銀蓮花，還特意去查花語。他們兩人在研究所被西海普收購前拍下的合照，就是後面玩家拾到的那一張。

政木的研究所當年參與了一項由國家諜報機關和企業聯手，私下進行的一項洗腦實驗「黃金蜂計劃」，而裡面研究的這種一經攝取就會令人產生幻覺或妄想的麻藥，被取名「碧翠絲」。
我們從政木弄掉的筆記和對玩家說的話，多少能看到他當年在想甚麼及做了甚麼……
2月6日，她來找我，帶著不久後要娶她的男人來跟我打招呼。聽了我說的「恭喜」，她對我露出了微笑。可是，我的內心卻彷彿吞了鉛塊一般沉重。
6月14日，據說她已經懷了身孕。是她和那男人的小孩。看來我得加快研究的速度了。
明顯政木這個一直等涼子明白自己心意的傻子在意中人滿心歡喜帶著自己看不起的男人來宣告婚訊後，一直壓抑自己的情緒，並有九成機會在暗中策著將來利用碧翠絲對涼子做些甚麼。

而我們從劇情尾段從晴人口中得知，當年的實驗者名單裡面，亦有出現研究員的名字，他們長久以來並不知道自己成了實驗品。因此不排除在政木得知涼子懷孕後，已經對涼子用藥，並秘不不報，所以涼子的名字未有出現在實驗者名單之上。而碧翠絲的某種副作用，導致了晴人的眼睛顏色變異及衍生出他能看到人心的能力。
3月20日，她返回了研究室的崗位。她的臉的輪廓，似乎變得比以前稍微圓潤了一點。剛來研究所的時候，她看起來就像個陶瓷娃娃。漸漸地，臉上才露出人類會有的表情。她給我看了剛出生兒子的照片，嬰兒長得像隻小猴子，讓我不知該說什麼。嬰兒的眼睛不知為何是鮮艷的藍色，但那對神似母親的明亮眼睛還是很美。
看上面的日記引文，再一次證明政木是個彆扭善妒的悶騷慫貨。要是涼子真的如他所描述，這樣不吃人間煙火的人，那麼對她的情商是不能抱有太大期望的。而在政木等候涼子發現自己對她的愛慕期間，就被主動表白的如月義人搶走了涼子的芳心了。【其實一切都是政木你自己作的孽呀⋯⋯真的沒啥好妒忌的。】

然而即使他和涼子之間再無可能，如月夫婦都死了，從他對玩家說的話，仍然感受到他對晴人的父親充滿妒忌。
晴人優秀的表現如其母翻版，完全感受不到混入那個無能父親的血。他那個父親，不管做什麼都不出色，無法理解涼子為何選擇那種人當伴侶。
隨著政木的心態越來越扭曲，終於他做了一件令他後悔莫及的事，並間接殺害了涼子。
他在別處幫「黃金蜂計劃」收尾前（可能是西海普的其他研究所或國家諜報機關設施），將所有參與過碧翠絲研究的研究員資料，從資料庫中刪除。避免他們的性命受威脅，但獨留下涼子的名字沒刪，然後涼子就出事了。（從看守員的口中得知，涼子是在未被告知計劃目的情況下參與研究的。因此「黃金蜂計劃」的實情，應該是只有後來刪除研究員資料的政木知道。）
雖然當年西海普解釋如月夫婦死因是：雨太大，他們借的公司車車胎因泥濘打滑而事。但從晴人的口中得知，當年的葬禮上，他就看到有幾個人莫名感到害怕。我們可以推測這幾個人是西海普或諜報機關看到研究名單上涼子的名字，為防「黃金蜂計劃」有洩密的可能，而威脅島上的某些職員對如月夫婦借用的車做手腳，從而滅口。

與此同時，當年島上亦發出了《緊急通緝情報》：有不明人士偽裝本設施的研究員，企圖盜取重要機密。年齡約20歲後半至30歲，女性。據曾與她談話的研究員指出，該名女性自稱為「亞里紗」。目標多是中午一個人吃午餐的男性研究員，以提供親手製作的便當為由，藉機找人攀談。據證詞指出，其便當非常美味，吃了男人將難以招架。提醒各位提高警覺，多留心注意。（這位女間諜的在遊戲一直有出現，而且可能是和看守員是一伙的，但這裡先不談，你們現在對女間諜有個印象就可以了。）
而劇情後面的小說《黃金蜂》則是在15年前，由島民參照5年前這宗因「黃金蜂計劃」引發的血案（如月夫婦「被意外」事件）改編而成的。雖然故事有潤色修改，但主體故事「人體實驗」仍然保留著。（這個島民應該是認識如月夫婦，並且有可能是當年其中一個參與研究的人。）

一個叫「碧翠絲」的研究員發現一種可用於精神療法的新藥成分，但藥效太強，導致逐漸偏離原來目的，運用到其他用途。後來發明者「碧翠絲」知道國家不惜用藥做人體實驗，良心苛責而自殺。
在如月夫婦死去的同年，島上的研究所關閉了，實驗看似停止，然而政木並沒有真的停止研究，（因沒有任何官方記錄，無人知道實際情況）並且等到晴人在海外畢業後，主動邀請晴人到他的研究所工作。（注意：政木同樣沒有告知晴人研究目的。）
於是大家的男朋友如月晴人就這樣傻呼呼的被政木坑了，協助政木的研究團隊以涼子的研究基礎，開發出完整形態的碧翠絲。

晴人在參與研究時，被政木安排成為主管級人物，晴人在研究時對自己沒信心的同時，又覺得研究項目古怪，但因政木總是對他說：
只要全力面對眼前的課題，自然就會出現成果。有些事只有你才辦得到。
晴人才定下心來，專注研究。而很明顯，政木是將涼子的形象投射到晴人身上。像極涼子模樣的晴人，在政木心中就等同於涼子復生，所以能開發出完美的碧翠絲只有晴人（他心中的涼子的延伸）做得到。
而在研究中途，晴人發現碧翠絲存在危險副作用：注射試藥的白老鼠出現異常甚至死亡。安全性太低，不能用於人體體驗。但政木卻視而不見，纂改實驗結果，阻止晴人上報。

晴人逼於無奈之下，企圖將研究成果和相關資料秘密帶出社外銷毀，但在處理資料時太專注，沒有發現政木進入了房間。政木發現晴人「背叛」了自己，感覺就如同30年前涼子在愛情上背棄自己一樣，於是情急之下從後襲擊了晴人。
晴人在失去意識前，聽到施襲者大叫：「涼子」，和感覺到被扭曲混濁、充滿恐懼【吐槽：政木你打暈人才開始害怕，會不會遲了點？】、無處宣洩的悲傷和後悔情感淹沒，感覺到施襲者的痛苦痛到極致。（政木是覺得涼子的替身晴人，要像涼子一樣被他害死，將要再度失去「涼子」而痛苦）在晴人失去意識前，他看到了施襲者身上的懷錶。（注意：晴人這個時候是不知道是政木打暈他的 。）

然而研究資料不是被晴人銷毀了，就是被藏起來了。政木要找回研究資料就只能從晴人身上下手，但晴人卻在這時候失憶了！（其實看透劇情就會知道，晴人從來都沒失憶過，只是在裝而已。晴人的演技都能拿小金人了。看我之後的解說就知道。）萬不得已之下，政木只能將晴人關起來，利用受他操控的輔導員打探剩下的研究資料所在。（政木手中只有樣本，沒有研究資料他甚麼都幹不了）
還記得上面我曾提過的女間諜嗎？那個女間諜在被通緝後，就僑裝成廚娘，在島上的食堂工作，以便監察島上的動向，找出「黃金蜂計劃」的詳情。而她在發現參與過研究的晴人被政木關在島上後，就聯絡她的Boss派人潛入島上接觸晴人，調查「黃金蜂計劃」。而這個被派去潛入的間諜、就是大家都熟悉的狩谷看守員。
一直潛伏在島上的女間諜：亞里紗
那麼狩谷的任務是甚麼？他就是阻截政木的人去做輔導員打探研究資料下落，在潛入期間負責引導不受政木操控的人擔任晴人的新輔導員。

而「假裝」失憶逃避政木追查的晴人，可能在和狩谷多次接觸後，達成了共識：他願意協助狩谷他們推政木下台，並且將「黃金蜂計劃」暴光；但狩谷他們卻要讓他完成「黃金蜂計劃」的最後一步——將完整形態的碧翠絲進行人體實驗。
之所以這樣推測，一是因為晴人本身對研究的熱誠；二是失去所有親人的他，被曾經以為是因賞識而重用，並關心他的政木背叛專業道德刺激，曾經相信的一切都不復存在時，他就只剩下埋藏心底的那份童年約定，而碧翠絲就是實現童年約定的唯一方法。
所以啊，作為玩家的你，其實從被綁架（其實不是真綁架）到島開始，就已經成為了完成「黃金蜂計劃」最後一環的白老鼠了！不信？那就繼續看下去。

還記得遊戲最開始嗎？你正在做一個夢，夢裡的你和一個年幼的黑髮男孩在一處懸崖上望海，並做了一個約定。
在這個時間，你其實已經被人注射了完整形態的碧翠絲，這個夢就是在給你加構虛假記憶的過程。可能是狩守和晴人達成共識後，從晴人手中取得完整形態碧翠絲，然後將晴人告知他的內容在你耳邊覆述。因為碧翠絲是能直接對腦內的受體起作用，引起幻覺的植物性生鹼，所以你的夢，不過是腦部受碧翠絲影響所造出來的幻象。
夢醒的你發現自己被綁去西海普的收容設施，見到你傻呼呼的狩谷對你說了以下的話：
怎麼瞪大眼睛，一副驚訝模樣？難道你甚麼都不知道？
經過調查，確認你是今天要來的人。
情況緊急，沒有經過程序就安排你來。
你看得懂狩谷話裡的意思嗎？他會問「難道」就是基於他認知中你是知道內情而來島上的。那是甚麼意思？

這就簡單了，既然「黃金蜂計劃」是這麼敏感的研究，作為狩谷的Boss（西海普裡某個和政木不合的高層）自然要確保萬無一失，那就絕對不會隨便在街上抓個人去當輔導員的。那麼很明顯被派進去的人，自然是和Boss一伙的或是在他/她底下做事的人，
亦即是你和亞里妙和狩谷一樣是一個間諜！
而你因爲被注射了碧翠絲，受副作用影響，導致了記憶出現障礙，所以忘記了自己來島的真正目的，以為自己是被人誘拐過去的。
記得你曾和狩谷說過要通知家人嗎？狩谷不就直接拒絕了嗎？說已經早就聯絡了。忘記了任務的你，這時候只記住了自己來島前設定的假身分，也就不認識同伙的狩谷了。

你或許會問，既然是一伙人，為何Boss會容許狩谷用自己做白老鼠？你需知道，這幕後Boss這麼多年來調查「黃金蜂計劃」要的除了數據，還有實證。既然現在有一支完整的試劑，而你又是聽他/她指示工作的人，何不順水推舟利用你呢？你這個實驗體若挺得住副作用不死，就是指證政木的一個工具；若不幸死了，亦能成為證據，證明政木研發的藥有多危險。
可憐的你，就是被大家一起坑了而不自知。
當你去見晴人時，他不就懷疑你的身分嗎？其實他不是在懷疑，他早就肯定你不是正式輔導員，這話只是刻意說給你聽，將你往圈套深處推進一步。
記得晴人會面說的話嗎？對你的心他分別說過這樣的話：
唯獨看不透你的心。
你的心像清澈的但又看不清的水。
結合兩句話的意思就暗示著，你的確被注射了碧翠絲，所以係藥效之下，使晴人的能力失效，所以才「唯獨」看不透你的心。

那麼「你的心像清澈的但又看不清的水」要怎樣解讀呢？這是晴人在暗示你，碧翠絲阻擋了你自身真實的情緒反應，所以你的心不再像常人能被他看到不同的顏色。
亦即是你現在就像一個人偶，所有心理活動都是基於操縱者（晴人）的操作衍生的。所以晴人只看得到受藥物表現出來的情緒反應，但看不到你內心真實反應，才會對你說這麼矛盾的話。
晴人之後也表示願意協助你的原因，是因為「你感覺敏銳，總能正中他的心。」這話又是甚麼意思？這就表示受碧翠絲影響的你，現在就像晴人的一面鏡子，會自動對晴人的期望作出相應的反應，所以才能不斷正中紅心。（正常人再了解一個人，都不可能凡事都猜得中對方心事呀。這話詭異之處，現在還覺得甜蜜嗎？）
晴人啊，可是有哄你說：「希望你多說自己的事，想要了解你。」你以為真的是想了解你嗎？才不是呢！晴人不過是想借你的成長經歷，去補完失聯的童年青梅竹馬的形象。記得上面我的假設嗎？你被狩守注射碧翠絲構建來自晴人口中的新記憶，
那麼現在你就等於是晴人的青梅竹馬，你的經歷就等於青梅竹馬的人生，所以晴人才想知道更多「你」的事。