1.化学药物法使用硫酸铜、草甘膦等化学制剂杀灭青苔危险较大，尤其是高温季节硫酸铜毒性加大。
采用化学方法虽见效快，但毒副作用最大。
2.物理遮光法根据青苔喜光的特性，可以使用草木灰和麦麸皮进行遮光防治。但由于草木灰容易受风的影响且吸水后不沉淀，使用效果不理想，所以多采用麦麸皮。
用物理法的特点就是不要全池泼洒，使用方便，但是麦麸皮腐败以后也会增加池塘的耗氧量。
3.使用针对水体青苔开发的一种生物酶东方青苔净，生物分解青苔，安全高效，用量小，见效快，无毒、无污染，对人、畜及各种水生动物无任何副作用。对各种水体中的青苔、丝状藻有独特的杀灭作用，一般晴天上午使用，下午见效。不伤害螃蟹塘水草及各种有益藻类，对鱼、虾、蟹及各种名特优水生动物安全。在无青苔水体中使用，也有净化水质，提高水体容氧量作用，定期使用有调节藻类与动物平衡之功能，确保水体处于上乘阶段。
用法用量：用前加入200倍水稀释，直接泼洒与青苔或丝状藻水面上。每亩每米水深用150g为宜，青苔大量生长时可适当加量。