养殖场污水主要包括牲畜的粪便及冲洗水，属于高浓度有机污水，而且悬浮物和氨氮含量较高，这种未处理的污水进入自然水体后，使水中固体悬浮物、有机物和微生物含量升高，改变水体的物理、化学和生物群落组成，使水质变坏。养殖无水中还含有大量的病原微生物。
养殖场污水所引起的污染主要有以下几个方面:一是带来严重恶臭污染空气。粪便在厌氧的环境条件下可分解成氨、硫酸、乙烯醇、二甲基硫醚、硫化氢、甲胺和三甲胺等恶臭气体，有腐烂洋葱臭、腐败蛋臭和鱼臭等臭味，这些气体危害人类健康，加剧空气污染。在恶臭物质中对人畜健康影响最大的是氨气和硫化氢。二是对水体造成有机污染。粪便的任意排放极易造成水体的富营养化，使水质恶化。粪便、污水渗入地下还可造成地下水中的硝酸盐含量过高。三是传播人畜共患病。由动物传染给人的人畜共患病有90余种，这些人畜共患病的载体主要是畜禽粪便及排泄物。
经济合理的步骤是——固液分离器+黑膜沼气+沉淀过滤+气浮过滤+AAO +MBR膜过滤+消毒工艺进行污水处理后达标排放。
污水首先经沼气池，废水在本单元中进行水解、酸化等一系列厌氧反应，其目的是将大分子量的蛋白质等有机污染物分解成分子量较小的有机物，分离后自流进入曝气调节池，污水经由提升泵提升至高效气浮机，污水在PAC、PAM的作用下进一步去除污水中的SS后自流进入中间水池，中间水池内的污水经由中间水泵提升至设备内双好氧池，废水在本单元中进行水解、酸化等一系列厌氧反应，其目的是将大分子量的蛋白质等有机污染物分解成分子量较小的有机物，以利于下一级单元的好氧生化处理出去水中的氨氮含量。经好氧处理后的污水进入MBR系统进行小分子细致过滤，进入二沉池进行消毒，最后流入清水池达标排放。