根据敕书很容易看出巡抚的权力：
1、节制文官，管理民政：专理该管地方，举劾文职贤否，粮饷刑名一切民事；所属司道以下各官，果有真心任事，廉能著效者，即据实举荐；如粉饰欺伪，贪酷殃民，庸懦溺职者，不时参奏。
2、在军事方面的权力：副将以下武职，听尔节制，并该管防守地方剿御贼寇，提调兵马；举劾武职贤否，一切军务，俱会同总督、提督行。如有武职骚扰地方，搅害良民，纵兵抢掠及隐匿贼情不报等事，听尔会同总督、提督纠参，从重治罪。
从敕书内容可以看出，巡抚只能节制副将（从二品，副总兵）及以下的武官（古代的以上以下都包括本数），连总兵都不能节制，更不可能节制提督了。巡抚处置武官必须会同总督、提督处理，没有单独处置权，实际上就相当于没有这方面的权力（总督处置武职可以单独上奏，无需知会巡抚）。
3、巡抚与总督的关系：尔仍听总督节制。
这就明确了巡抚与总督的关系，巡抚必须受总督的节制，据此巡抚见了总督就必须自称下官。在处理民政方面，巡抚有单独上奏权，所以独立性比较大，但是这不能否认总督节制巡抚的事实。

再看看总督的任职敕书：
给闽浙总督福康安敕谕
皇帝敕谕御前大臣太子太保协办大学士吏部尚书兼兵部尚书都察院右都御史一等嘉勇公福康安：兹特命尔总督福建浙江等处地方军务，兼理粮饷盐课，驻札福州府，宣布德意，收拾人心，严饬文武官吏，修浚城池，简阅器械，稽察奸宄，查解逃人，设险固防，修理战舰，操练兵马，裕储核饷，信赏必罚，弭盗安民。一应战守机宜，悉听便宜区处。戒谕文武将吏，共图保障。该省巡抚、提督等官，听尔节制。如有寇贼生发，即应指授方略，督率提督镇将等官，发力剿灭，无使滋蔓。仍申明纪律，禁约官兵，使所过地方，秋毫无犯。贼若悔罪弃戈，实心归顺者，准与招抚安插；依山据海，负固不服者，设法招抚，务须区处得宜。如招抚事体重大，奏请定夺。内地小盗，严责各汛防官及州县卫所印捕官员缉擒。有隐匿贼情不报者，即行纠参，从重治罪。如有钻投文武各衙门充为标员吏役、暗通贼信、及潜出行劫者，其滥收官员，不分守土驻防，纠参重处。大兵出征，往来境上，须行各该有司将粮草船只预先备办，应时支给，毋容州县卫所横征科派，苦累穷民。该省官兵各有统辖，尔须与统领官及巡抚、提督等官计议而行，有不法扰民者依法处治。其驻防旗下兵丁，有扰害百姓、妄行生事者，尔会同该管官审问，严行治罪。军资粮饷，应时支给，事竣参核。漕粮船只，沿河拨兵护送，毋致疏虞。其兵马实数，向系道臣查点，今停其查点，听尔督同巡抚、提督选择武官内廉干者查点，如有虚冒，即行指参。有与各省督、抚相关者，即会同酌议施行。邻省如有兵事，移会犄角策应。尔尤须正己率属，所统文武大小官员，必常加申饬，令其约束衙门官役俾一遵法纪，罔敢作弊生事，扰害军民。用兵之际，有稽迟粮运、违误军机、或临阵退缩、杀良冒功及借军剥民，侵饷肥己者，文官六品以下，武官四品以下，会同巡抚、提督，以军法从事。巡抚、提督、镇道等官，飞章参奏，候旨处分。所属文武官员，一秉至公，严行甄别。有实心任事，廉能着效，即据实举荐；贪残庸懦，轻则降黜，重则拿问，具疏奏闻。兴利除害，有裨地方事宜，敕中开载未尽，许便宜区画。尔膺兹重寄，须持廉秉公，摅忠殚力，俾盗贼屏息，地方宁谧，斯称委任。如因循怠忽，或处置乖方，致误重地。责有所归，尔其慎之！故谕。
乾隆五十三年十二月十七日

在总督敕书中同样有“该省巡抚、提督等官，听尔节制”的语句，据此总督就可以节制巡抚和提督，统管所辖省份的文武官员。
1、总督的职权：从敕书内容来看，总督的职权主要在军事和治安方面（古代军警不分，军队也有维持治安的职责和权力）。在军事行动中，总督只能以军法直接处置“文官六品以下，武官四品以下”，对巡抚、提督、镇道等官，只能“飞章参奏，候旨处分”。也就是说，巡抚提督总兵级别的官员在军事行动中即使抗命，总督也不能以军法将他们直接处决，只能请旨处理。从“文官六品以下，武官四品以下”来看，可以看出文官和武官的品级差距，武官品级与文官比较，大概需要降低两级。
2、总督在民政方面的职权：戒谕文武将吏，共图保障。尔尤须正己率属，所统文武大小官员，必常加申饬，令其约束衙门官役俾一遵法纪，罔敢作弊生事，扰害军民。所属文武官员，一秉至公，严行甄别。有实心任事，廉能着效，即据实举荐；贪残庸懦，轻则降黜，重则拿问，具疏奏闻。
总督在民政方面的权力侧重于监督，即考察举荐、弹劾所辖省份的文武官员。显然，所辖省份的民政主要归巡抚直接处理，巡抚在处置时征得总督同意即可。在实际运作时，省里的权力由布政使（人事、财政、民政）和按察使（司法）行使，巡抚监督二司办事。在和平时期，军事事务不多，总督也“积极”监督二司办事，实际上是侵夺了巡抚的权力（但是敕书中有总督节制巡抚的规定，也不能说总督的这种行为就是违规的）。在督抚同城的地方，布政使一般先请示总督意见，然后再去咨询巡抚意见。如果他们的意见不同，下面的人会很难办。通常，督抚之间不会闹得太僵，表面上还是同心办事的。省里如果要出个规定，总督巡抚会联合发文。

清末云南巡抚获得兵部侍郎的头衔后，仍然不能节制总兵：
上谕：敕谕兵部侍郎兼都察院右副都御史岑毓英：兹特命尔巡抚云南等处地方，赞理军务，兼理粮饷，驻扎省城，专办通省地方事务，举劾文职贤否，粮饷刑名一切民事。尔宜宣布德意，抚安人民，约束衙门员役，使之恪遵法纪，毋致作弊生事，扰害兵民。操练兵马，修浚城池，询访民瘼，禁缉奸顽。所属地方应征应免钱粮皆照户部题过新定经制，遵行晓谕，仍细加体察，如有司各官朦胧重收，借端苛派，参奏处治。严饬所属，察解逃人。凡地方利弊，有可苏息民困，振饬维新者，逐件条奏请旨施行。地方备储之计，如常平社仓等事，责令有司力行修举。境内逃丁荒粮，责成道府转行有司，从实察核造册开报，应蠲豁者奏请蠲豁。晓谕招徕，劝课农种，严禁滥征侵占，使民人乐业。毋容有司将现存人户概派包赔，以至重累黎民。所属司道以下各官，有实心任事、廉能著效者，即据实举荐；如粉饰欺伪，贪酷殃民，庸懦溺职者，不时参奏；副将以下武职，听尔节制，并该管防守地方，剿御贼寇。提调兵马，举劾武职贤否，一切军务，会同总督、提督行。如有武职骚扰地方，搅害良民，纵兵抢掠及隐匿贼情不报等事，听尔会同总督、提督纠参，从重治罪。尔仍听总督节制。敕中开载未尽事宜，听尔详酌施行。年终将行过事迹及兵饷钱粮造册送部察考。尔膺兹委任，须持廉秉公，殚心竭力，以副委任；如怠玩废驰，贪黩乖张，贻误地方，责有所归，尔其慎之。故谕。
同治七年十二月十九日