是的，牛顿自然哲学里的数学原理是科学的。他提出了三大定律，第一定律、第二定律和第三定律。第一定律即牛顿就是物体在运动的时候，如果没有外力干涉，物体就会一直保持匀速运动，第二定律牛顿定律可以用来计算物体受到外力干涉时加速度的大小，第三定律又称作斥力定律，即两个物体之间有相互斥力。这些一些数学原理已经被大量的实验证实，所以它被认为是科学的。除此之外，牛顿还提出了广义相对论，平方反比定律，以及光谱学等理论，都被认为是真实有效的科学原理。