序列数据库由Neil J.A.Sloane（以下简称“NJAS”）于1964年初创建，当时他还是纽约伊萨卡康奈尔大学的研究生。他在写论文时遇到了一系列数字，即1，8，78944。。。（现在OEIS中的条目A000435），并正在寻找第n项的公式，以确定这些项的增长率。
他注意到，尽管康奈尔大学图书馆的几本书中都有与此相似的序列，但这一特定序列并没有被提及。为了跟踪这些书中的顺序，NJAS开始将它们记录在文件卡上，并将其按字典顺序排序。
这是NJAS论文笔记本
https://oeis.org/A000435/a000435_2.pdf上第一批序列的扫描页
https://oeis.org/A000435/a000435_1.pdf。（提到的序列是A000027、A000217、A000292、A000032、A000389、A000779、A000110、A0007318、A000058、A000215、A00029、A000324、A234953（=A001854（n）/n）、A000435、A000169、A000142、A000272、A000122、A000111。）这是OEIS生长的橡子。日期是1964年1月或2月。
1967年，这些序列被转移到穿孔卡片上，并于1973年被制成一本书（《整数序列手册》，NJAS，纽约学术出版社）。这本书包含2372个序列。
【顺便说一句，今天这些卡片有时被称为“穿孔卡片”（原文如此）。这是错误的，它们总是被称为”穿孔卡片“。任何说”穿孔卡片”的人都表明他们对这个主题一无所知。说”穿孔卡“就像说”徒步靴“、”手杖“或”口香糖“。】
1969年，NJAS加入美国电话电报公司贝尔实验室。这本书出版后，收到了大量信件，建议对现有条目进行进一步的排序和更新。许多人评论说，他们发现这本书是多么有用，令人惊讶的是，以前没有人出版过这样的书集。
到20世纪90年代初，已经积累了超过1立方米的信件。加拿大数学家Simon Plouffe主动提出帮助准备这本书的修订版，1995年，NJAS和Simon Plouff的《整数序列百科全书》由圣地亚哥学术出版社出版。它包含5487个序列，占据587页。（顺便说一句，Simon Plouffe现在是OEIS基金会股份有限公司的受托人之一。）
同样，这本书一出版，世界各地的人们就提交了许多进一步的序列和更新。NJAS等了一年，直到收藏的数量翻了一番，达到10000个条目，然后在1996年，他在互联网上推出了整数序列在线百科全书®（OEIS®）。从1996年到2009年10月26日，这是NJAS在AT&T实验室网站上主页的一部分
在此期间，从1996年到2009年，数据库每年至少增加10000个条目（仅2009年就增加了18000个新序列）。如果今天以图书形式出版，OEIS将需要750多卷，每卷的大小相当于1995年的书。
从2002年开始，NJAS增加了一组副编辑来帮助处理提交的文件。然而，由于他们无法访问维护数据库的计算机，几乎所有的更新工作都必须由NJAS独自完成。这涉及到每天处理100或200封电子邮件，而且已经超出了一个人的处理能力。
因此，在2009年，它决定做出一个巨大的改变。NJAS成立了一个非营利基金会，即OEIS基金会股份有限公司，其目的是拥有、维护和筹集资金，以支持在线整数序列百科全书®（OEIS®）。2009年10月26日，NJAS将整数序列在线百科全书的知识产权转让给基金会，并开始将数据库从NJAS在at&T的主页转移到商业托管服务。
然而，在这里，我们遇到了一个非常严重的问题。2009年夏天，当我们试图让OEIS作为一个wiki工作时，我们发现Mediawiki软件无法处理在查找序列时出现的那种查询。这是一场灾难。
我们花了一年多的时间才解决这个问题。最后，Russ Cox完全重写了维护数据库和回答查询所需的所有程序——这是一项艰巨的任务！NJAS的同事David Applegate也为新系统的运行提供了巨大帮助。由于他们的工作，新的OEIS终于在2010年11月11日推出。现在，世界上任何人都可以提出一个新的序列或对现有序列的更新。为此，用户必须首先注册。已经成立了一个由大约130名编辑组成的小组，他们的工作是在投稿成为OEIS的永久组成部分之前对其进行审查。
因此，经过近两年的斗争，OEIS终于能够在没有NJAS批准每一项变更的情况下运作。在运行数据库46年后，这让他松了一口气。
