在正常的流量下，压差的上升通常是由于膜元件水流量通道的隔网进入杂质，污染物质和水垢引起的，导致产水流量的下降。
当超过设定的给水流量时，也会发生过大的压差，当启动时给水压力提升过快，发生水锤压差会很大，如果膜已经被污染，特别是微生物污染，压差也会增大。
给水至浓水间的压差表示的是水力阻力，与给水的流速、温度有关，应该保持产水和浓水有一定的流速。
出现高压差的可能性有：水垢、微生物污染、阻垢剂沉淀、过滤器过滤介质漏、给水/浓水密封损坏。