第一部完结，第二部开始。

山姆去大学之前发现自己包里有魔方碎片，结果魔方碎片把内部数据刻在了山姆脑子里。

后来军方保管的另一个碎片被偷用于复活威震天，威震天复活后去见堕落金刚，威震天得知山姆脑子里的魔方数据可以帮助他们重建种族。（威震天不应该是个瘸子么）

于是威震天派霸天虎去抓正在读大学的山姆，山姆，里奥和米凯拉在学校遭到爱丽丝（女霸天虎）袭击，后开车撞死爱丽丝，但车被冲浪板吊起带走，送至威震天处。（别紧张）

正直霸天虎要剖开山姆脑袋，擎天柱带来汽车人赶到，营救山姆。

擎天柱先带山姆离开，汽车人殿后，而威震天和擎天柱在树林大战，威震天派来红蜘蛛和冲浪板，擎天柱遭三人围攻，负伤杀死了冲浪板，砍断了红蜘蛛一只手臂。后为救山姆遭威震天偷袭用刀穿心杀死。（三个臭皮匠的逆袭）

山姆三人与大黄蜂和双胞胎离开，铁皮，救护车，横炮则回到军营。山姆后来找到了第七区的西蒙特工，请求他帮助，而此时米凯拉抓的小霸天虎转轮派上了用，他帮助山姆找到了早期到达地球的变形金刚天火。

而此时堕落金刚带领霸天虎军队来到了地球。企图得到原能矩阵以摧毁太阳。（太阳：我特么招谁惹谁了）

其他汽车人也随军队赶到埃及并把擎天柱的遗体带来，山姆根据天火给的暗语，找到了原能矩阵所在地，还看到了元老的遗体。

但原能矩阵化为了灰。山姆不放弃带着这些碎屑冲向擎天柱，遭到霸天虎围追堵截。（围追堵截就是打不着）

汽车人与霸天虎大战，天火也前来支援，但遭偷袭身负重伤。（天火装逼失败）

而山姆被威震天的武器伤到，倒在地上昏死了过去，在昏死时见到了那些死去的元老，告诉山姆：“原能矩阵不是被发现的，而是通过努力得到的，你奋不顾身拯救擎天柱具有领袖风范，去吧."山姆醒来，原能矩阵也变回了原样，山姆复活了擎天柱。

但堕落金刚夺走了原能矩阵，前往金字塔顶端运行机器摧毁太阳。山姆不断鼓励擎天柱站起来。但擎天柱因伤无力再战。

而天火则请求擎天柱用自己的火种去和堕落金刚战斗，天火牺牲了自己，擎天柱借用天火的身体，飞往金字塔，摧毁了机器并与堕落金刚和威震天战斗。（瞬间强大起来）